Игрок выступает в роли безымянного бойца морской пехоты. Он описывается как «один из наиболее крепких, закалённых в боях и натренированных землян», который был сослан на Марс после убийства командира, приказавшего уничтожить безоружных поселенцев. Он работает на Объединённую Аэрокосмическую Корпорацию (Union Aerospace Corporation, UAC), военно-промышленный конгломерат, проводящий секретные исследования по телепортации между спутниками Марса Фобосом и Деймосом. Внезапно эксперимент даёт сбой, и из ворот телепортации появляются существа из ада. Служба безопасности не в состоянии остановить вторжение, демоны быстро овладевают базой, убивая весь персонал. Одновременно с орбиты полностью исчезает Деймос. Отряд UAC посылают с Марса на Фобос, чтобы выяснить, что же всё-таки произошло, но вскоре радиосвязь с этим отрядом прерывается, и только один боец остаётся в живых — сам игрок, чьей задачей становится выбраться с базы живым.
Действие игры начинается вскоре после событий Doom. Игрок снова управляет безымянным морпехом, расправившимся с силами ада на Фобосе и Деймосе в оригинальной игре. Оказавшись на своей родной Земле, он обнаруживает, что она тоже стала жертвой нашествия монстров.
TNT Evilution: Не смотря на то, что никого из руководства UAC не осталось в живых, а весь остальной персонал, вплоть до уборщиков помещений находился под государственным контролем, работа корпорации продолжалась. Теперь база UAC была размещена на одном из спутников Юпитера в расчете на то, что огромное расстояние до Земли будет способствовать безопасности планеты, если что-то в ходе экспериментов пойдет неправильно. Охраняющие базу пехотинцы были хорошо вооружены и готовы к любому вторжению.
Вскоре после того, как в ходе эксперимента были открыты Ворота-телепорт, чудовища, словно порожденные адом, сделали первую попытку атаковать базу. Но вторжение кибердемонов с бронированными конечностями и острыми клыками было обречено на неудачу - космические пехотинцы были хорошо подготовлены и вооружены до зубов. С незначительными потерями они отразили атаку выходцев из ада. Сражение закончилось также внезапно, как и началось. Когда умолкли крики последнего пылающего черепа, то в абсолютной тишине раздавались только звуки капающей крови...
Ад был побежден, а все воины получили правительственную награду - Серебряную Звезду. Эта победа позволила продолжать эксперименты более смело, но при этом - менее осторожно. И хотя защитные позиции были усилены, а воины - готовы к очередной атаке, их внимание было обращено только к Воротам, в то время как опасность поджидала их с другой стороны...
Спустя несколько месяцев после инцидента у экспериментальных ворот прибывает космический корабль с ежегодными поставками всего необходимого для жизни и работы людей. Однако, корабль прилетел раньше обычного срока и на экранах радиолокационных операторов выглядит несколько странно. Упустив это из виду, персонал космопорта дает разрешение на посадку, однако корабль не спешит приземляться, а висит над военной базой. Этот корабль - биомеханическое чудовище, созданное в глубинах ада, пришел для того, чтобы мстить за поражение в предыдущей битве...
Уродливые чудовища, сметая все на своем пути, захватывают базу. Люди либо погибают, либо превращаются в зомби, цель жизни которых - убивать всех и все, не боясь при этом собственной смерти. Избежать гибели или зомбирования удалось только одному человеку - командиру погибших пехотинцев. Когда произошло вторжение выходцев из ада, командир находился вне пределов базы. Поняв по ярким вспышкам, что на базе происходит что-то неладное, главный герой поспешил вернуться и вместо своей команды застал только монстров из ночных кошмаров...
Командир мечтал о мести за своих погибших ребят и не боялся смерти - если аду было суждено получить его жизнь, то достаться она ему могла только в борьбе с захватчиками...
The Plutonia Experiment: После разрушительного вторжения сил Ада на Землю, правительство приняло меры для предотвращения подобной атаки и усиления безопасности. Но, не смотря на то, что уничтожение оставшихся демонов успешно продолжалось, было ясно, что силы Ада не потеряли свою мощь и потому необходимо быть настороже.
Корпорация UAC создала новый управленческий состав и начала работу над исследованием новых средств и технологий, которые могли бы остановить новое вторжение захватчиков. Одновременно с этим, корпорация разрабатывала квантовое устройство, позволяющее открывать и закрывать Ворота-телепорт на значительном расстоянии от них, что было очень важно, учитывая возможность нового вторжения. Но для того, чтобы создать такое устройство, ученым необходимо было понять технологию работы Ворот. Эксперименты с Воротами не могли не привлечь внимания выходцев из ада. И однажды сделали попытку прорваться сквозь открывшиеся Ворота, но квантовый акселератор вполне справился со своей задачей и закрывал Ворота при первой же попытке проникновения демонов. Таким образом, Земля могла бы быть в полной безопасности, если применить новую технологию управления телепортами вокруг всего земного шара.
На следующий день, когда кольцо из семи ворот было открыто, неожиданно сквозь них хлынул легион чудовищ. Квантовый акселератор успел закрыть шесть ворот, но т.к. адская армия была многочисленна и очень сильна, ей удалось прорваться сквозь последние Ворота и атаковать землян. В этой битве погибли все - военные, ученые, чиновники, а те, кто не погиб - превратились в зомби-убийц...
Квантовый акселератор похоронен в глубине разрушенного научно-исследовательского комплекса, а последние Ворота охраняются стражем-чудовищем. Правительство, находясь в отчаянии при мысли, что квантовый акселератор может быть использован силами ада, отдает приказ всем военным, вне зависимости от их расположения, мобилизовать все силы и отразить атаку монстров. Главный герой игры находился недалеко от комплекса, когда получил приказ о мобилизации. Чудовищный рев, яркие вспышки света, разбросанные трупы и море крови вокруг... Герой понимает, что вскоре Страж ворот доберется до акселератора и тогда случится непоправимое. Ожидаемая поддержка военных сил прибудет слишком поздно, когда монстры завершат свою ужасную задачу и тогда уже ничто их не остановит - ни авиация, самолеты которой будут сметены с неба адскими силами, ни артиллерия, пушки которой будут уничтожены ракетами и огненными шарами чудовищ, ни пехотинцы... Через час или два весь мир будет принадлежать монстрам... И задача главного героя - войти в научно-исследовательский комплекс и остановить Стража ворот. И сделать это придется одному...
Групировки
